La série la plus méconnue issue de l’esprit torturé de Chris Carter (Millenium,
Harsh Realm) est pourtant celle qui s'inscrit le mieux dans l’univers d’X-Files puisqu’elle en est tout simplement un spin-off. Les trois protagonistes de celle-ci furent ainsi créés par Darin Morgan et James Wong lors de la première saison des aventures des agents Mulder et Scully lors de l’épisode "Entité Biologique Extraterrestre" et furent même un temps envisagés pour seconder cette dernière lorsque se profila la possibilité d’un départ de David Duchovny. Ils restèrent au statut de récurrents jusqu'en 2001 où Chris Carter, Vince Gilligan, John Shiban et Frank Spotnitz, alors producteurs et scénaristes sur X-Files, lancèrent ce premier spin-off intitulé The Lone Gunmen qui héritera aussi du compositeur de la série mère (Mark Snow), d’une grande partie de son équipe technique (de Bowman à Braidwood) et de ses grandes marques de fabrique. On reconnaitra en effet le pré-générique atypique, le lettrage indiquant la ville et l’état de l’action, et la tonalité des épisodes parodiques de la série. Malheureusement arrivée en remplacement de mi-saison (en Mars) la série n'ira pas au delà des 13 épisodes initialement commandés, tandis que son intrigue trouvera toutefois une conclusion lors de la dernière saison d'X-Files (l’épisode "N'abandonnez Jamais").

The Lone Gunmen suit donc les enquêtes de Richard Langly, Melvin Frohike et John F. Byers respectivement le hacker, l'homme d'action et l'idéaliste en quête de la vérité pour les livrer au public via leur journal auto-publié. Ils sont rapidement rejoints par Jimmy Bond (Stephen Snedden) qui amène sa naïveté et son enthousiasme à l’équipe, et fournit accessoirement un point d'attache et d’introduction à tout spectateur qui ne serait pas familier avec X-Files. L’équipe sera finalement complétée par Yves Adele Harlow (Zuleikha Robinson) hacker, chasseuse de prime et voleuse qui viendra souvent en soutien à nos quatre journalistes.

Le pilote de The Lone Gunmen est devenu tristement célèbre pour une part de son intrigue : le fameux scénario 12D voit ainsi le détournement d'un avion de ligne pour se crasher dans le World Trade Center. Un caractère (pour certains) prophétique qui, au printemps 2001, a complètement faussé la perception du pilote. En effet, la série aborde ici ses trois grandes forces directrices : la thématique d'une reconquête du patriotisme, ici clairement en son sens premier, couplée à la foi du pays et de ses valeurs. Une foi que les trois Lone Gunmen sont d’ailleurs sur le point de perdre au début de la série, ce qui pour un spin-off d'X-Files (qui passe son temps à remettre en cause l'intégrité de la machine d'état américaine) était un challenge que le ton de l’ensemble se chargera de régler.